Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD13P35453 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD13P35453 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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