Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MAP3K7CL-203ENST00000341618 1855 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPREP23469 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPREP23469 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPREP23469 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPREP23469 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPREP23469 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPREP23469 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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