Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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