Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ERVMER34-1-202ENST00000443173 3830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 DPH3P1-201ENST00000486648 249 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RPL12P37-201ENST00000486874 495 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LINC00663-204ENST00000588223 565 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 C12orf43-201ENST00000288757 4469 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SLC11A2-205ENST00000545993 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 OPRM1-202ENST00000330432 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SEC14L3-202ENST00000401751 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AL049775.1-201ENST00000380722 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 FXR1-201ENST00000305586 3277 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AP000532.2-201ENST00000428118 1730 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 NT5C1B-202ENST00000359846 2475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 GBP6-201ENST00000370456 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC136944.2-201ENST00000568752 3971 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 IDSP1-201ENST00000324799 376 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 GH2-201ENST00000332800 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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HOXD11P31277 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC020905.1-201ENST00000587777 575 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC215522.2-201ENST00000635373 600 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 STEAP3-201ENST00000393106 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 LINC01193-201ENST00000553416 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 TDRD3-202ENST00000377881 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HOXD11P31277 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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