Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAMTA1Q9Y6Y1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAMTA1Q9Y6Y1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms