Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMC3Q9Y6N6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.79■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LAMC3Q9Y6N6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMC3Q9Y6N6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms