Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM17Q9Y577 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM17Q9Y577 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms