Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS5Q9UPZ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms