Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAF8Q9UPN6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms