Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms