Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2Q9UMS6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms