Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CIZ1Q9ULV3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms