Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms