Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAX2Q9UIW0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms