Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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