Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX20Q9UHI6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms