Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms