Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP36Q9P275 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP36Q9P275 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms