Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP5Q9NZZ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms