Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf78Q9NZ63 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms