Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms