Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA2D2Q9NY47 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms