Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT1Q9NXH9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms