Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN6Q9NWW5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN6Q9NWW5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms