Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLE1Q9NVX2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLE1Q9NVX2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms