Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8A2Q9NTI2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A2Q9NTI2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms