Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMILIN3Q9NT22 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMILIN3Q9NT22 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms