Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOMER2Q9NSB8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER2Q9NSB8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms