Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPRMQ9NS64 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms