Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRN4Q9NRL3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN4Q9NRL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms