Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BATF3Q9NR55 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms