Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPCPD1Q9NPB8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPCPD1Q9NPB8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms