Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAT1LQ9HCJ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms