Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms