Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRDE2Q9H7Z3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms