Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF1Q9H7N4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms