Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf49Q9H6J7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms