Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF41Q9H4P4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms