Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00597Q9H2U6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00597Q9H2U6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms