Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD1Q9GZZ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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HOXD1Q9GZZ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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HOXD1Q9GZZ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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HOXD1Q9GZZ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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