Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NYXQ9GZU5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NYXQ9GZU5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms