Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms