Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHACTR1Q9C0D0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHACTR1Q9C0D0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms