Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4CQ9C0C4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms