Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP4Q9C0A0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP4Q9C0A0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms