Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA7Q9BWT1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA7Q9BWT1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms