Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFT27Q9BW83 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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