Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3CQ9BUI4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3CQ9BUI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms