Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms