Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms